Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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