Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms