Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXTL2Q9UBQ6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms