Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFIP11Q9UBB9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms