Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNQ9P2M7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNQ9P2M7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNQ9P2M7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNQ9P2M7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNQ9P2M7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNQ9P2M7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNQ9P2M7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNQ9P2M7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGNQ9P2M7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNQ9P2M7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNQ9P2M7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNQ9P2M7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGNQ9P2M7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms