Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms