Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms