Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EHD3Q9NZN3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms