Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms