Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
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