Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDK12Q9NYV4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK12Q9NYV4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms