Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms