Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO28Q9NVF7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms