Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZCCHC3Q9NUD5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZCCHC3Q9NUD5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZCCHC3Q9NUD5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZCCHC3Q9NUD5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZCCHC3Q9NUD5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZCCHC3Q9NUD5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZCCHC3Q9NUD5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZCCHC3Q9NUD5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZCCHC3Q9NUD5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZCCHC3Q9NUD5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZCCHC3Q9NUD5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZCCHC3Q9NUD5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZCCHC3Q9NUD5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZCCHC3Q9NUD5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZCCHC3Q9NUD5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZCCHC3Q9NUD5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZCCHC3Q9NUD5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZCCHC3Q9NUD5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms