Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PDS5BQ9NTI5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms