Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms