Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPMQ9NSP4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms