Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A13Q9NSD5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms