Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms