Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms