Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PHPT1Q9NRX4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms