Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS45Q9NRW7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS45Q9NRW7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms