Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms