Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms