Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms