Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms