Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms