Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms