Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPF2Q9HAU5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms