Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF408Q9H9D4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms