Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKRIP1Q9H875 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms