Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms