Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms