Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms