Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms