Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms