Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCO2Q9BYV7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms