Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms