Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms