Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms