Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF17Q9BXT8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms