Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.7 ms