Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC94Q9BW85 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms