Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP58Q9BVL2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms