Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM208Q9BTX3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM208Q9BTX3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms