Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms