Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms