Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNS3Q9BQ31 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNS3Q9BQ31 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNS3Q9BQ31 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNS3Q9BQ31 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNS3Q9BQ31 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNS3Q9BQ31 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNS3Q9BQ31 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNS3Q9BQ31 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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KCNS3Q9BQ31 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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KCNS3Q9BQ31 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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KCNS3Q9BQ31 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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KCNS3Q9BQ31 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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KCNS3Q9BQ31 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNS3Q9BQ31 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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