Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms