Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRNT1Q96Q11 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms